מנהל מע"מ רשאי לסרב לרישום עוסק כאשר הוא סבור שהפעילות אינה עונה על ההגדרה של "עסק" לפי חוק מע"מ או כאשר מתעורר חשד לפעילות לא חוקית.

העילות הנפוצות לסירוב כוללות:

• היעדר פעילות עסקית ממשית – כאשר מבקש הרישום אינו מציג ראיות מספקות לקיומו של עסק פעיל.
• קשר לעבירות מס קודמות – כאשר מבקש הרישום היה מעורב בעבר בעבירות מס (שימוש בחשבוניות פיקטיביות).
• שימוש באנשי קש – כאשר מתעורר חשד כי הבקשה נעשתה על שם אדם אחד, בעוד בפועל אדם אחר מנהל את הפעילות.
• אי מהימנות אישית או כלכלית – כאשר הבקשה מוגשת על ידי אדם עם רקע בעייתי, פשיטות רגל חוזרות או חובות לרשות המסים.

סירוב לרישום עוסק מונע מהמבקש לנהל עסק באופן חוקי, ובכללן: אי יכולת להוצאת חשבוניות מס, אי ניכוי מס תשומות, חשיפה פלילית, קושי תדמיתי.